La escuela con el nombre INSTITUTO MOTOLINIA se incorporó a la Universidad Autónoma de Aguascalientes el 16 de junio de 1992, hasta el mes de agosto del 2002. Se ubicó en Alameda núm. 131, La Purísima, zona Centro del Estado de Aguascalientes, en el estado del mismo nombre. El Fondo del Instituto Motolinia, está compuesto por libros de actas de calificaciones que contienen datos tales como: los nombres de los diferentes alumnos que han cursado sus estudios en esta escuela a partir de su incorporación, las materias impartidas y el nombre del profesor, así como las calificaciones finales de cada semestre, y firma de los maestros titulares de la materia y/o el director, según la fecha del acta expedida por la escuela. En el fondo se encuentran los expedientes de alumnos, los cuales contienen el historial académico. También contienen la documentación de los procesos administrativos, correspondencia, listados y registros que muestran la vida académica y el desarrollo de la institución. La documentación existente en el fondo del Instituto Motolinia, se encuentra dentro de los 73 metros lineales que conforman en su totalidad el acervo perteneciente a las escuelas incorporadas en nuestra Institución.